Многообразие климата Азербайджанской Республики обусловило разнообразие животного мира. Фауна Республики насчитывает 96 видов млекопитающих, 357 видов птиц, 54 вида пресмыкающихся, 10 видов земноводных, более 100 видов рыб, более 17 тысяч беспозвоночных. Ареал распространения животных на нашей территории различен.
На территории лесного пояса Талышских гор и Ленкоранской низменности отмечено более 40 видов гнездящихся птиц, из которых около 25 видов держатся здесь оседло. Еще около 25 видов птиц зарегистрировано в окрестностях данной территории, их обитание на данной территории считается возможным. В лесах обитают зяблик, зарянка, большая синица, московка, длиннохвостая синица, крапивник, лесная завирушка, лазоревка, зеленушка, черный и певчий дрозды и др. На водохранилищах можно увидеть различных уток, большую белую и серую цапель, орлана-белохвоста и др.
В лесном поясе Талышских гор и Ленкоранской низменности живут 18 видов млекопитающих: косуля, кабан, дикобраз, ласка, каменная куница, барсук, выдра, камышовый кот, рысь, медведь и полосатая гиена. Акклиматизированы пятнистый олень и енот-полоскун. Дикобраз вполне обычен в окрестностях Ханбуланчайского водохранилища и по склонам г.Нисияку. В глубине лесов дикобраз очень редок; он поселяется недалеко от сельскохозяйственных угодий, куда часто наведывается в поисках пропитания. Для нор дикобраз выбирает самые сухие склоны. Часто эти норы использует барсук, выгоняя хозяев. Крупные норы занимают площадь около 40 м. Косуля стала в Талыше редким животным. Она держится в наиболее труднодоступных местах на крутых склонах, избегая густых зарослей и сильно захламленных участков леса. Из лучших угодий косулю вытеснил пятнистый олень.
В 1952 году в Азербайджан с Уссури привезли 13 пятнистых оленей. Более 20 лет их содержали в вольерах в Алтыагачских лесах. В 1970 году оленей стало уже 100; через четыре года 77 оленей перевезли в леса Талышских гор. Здесь пятнистые олени успешно прижились, увеличив свою численность за 10 лет более чем на 50%. Пятнистые олени держатся в лесах не выше 500 м, придерживаясь в основном мест с относительно спокойным рельефом и избегая глухих ущелий.
Численность кабана на Ленкоранской низменности и в горах Талыша и в общем все время сокращается. И все же здесь кабаны могут чувствовать себя более или менее спокойно. Благоприятные климатические условия - мягкие малоснежные зимы и достаточные запасы кормов позволяют кабанам жить здесь круглый год. Больше всего кабанов в верхней части хребтов Улясы, Гуглябанд, Бакусыг. В других местах, особенно, в бассейне реки Паракан, в районе г.Нисяку и на северном побережье Ханбуланчайского водохранилища, кабаны встречаются реже.
Выдра, ставшая повсеместно на Кавказе редким зверем, обитает в Ханбуланчайском водохранилище и по р.Вашаруд. Рысь редка; она держится на самых глухих участках.
Волк избегает крупных лесных массивов и постоянно не живет в лесах Талышских гор. Шакалы распространены в лесах нижней полосы, в зарослях кустарников, вокруг населенных пунктов. С поднятием в горы их численность уменьшается, и выше 500-600 м. они встречаются редко. Прежде на Ленкоранской низменности был многочислен камышовый кот, но в последние десятилетия его ареал резко сократился. Сейчас основные районы распространения лесного кота - это "Московский лес" и окрестности Ханбуланчайского водохранилища. Барсук обитает в основном на склонах гор, окружающих водохранилище, в урочищах Паракан, Пиаболил, у подножия г.Бакусыг и др. В низинном лесу практически не встречается. Каменная куница встречается в горах, но распространена неравномерно. Енот хорошо прижился, особенно, в лесах низменности предгорий. Больше всего енотов обитает вокруг водохранилища, в бассейнах рек Параканчай, Вашаруд, Шаламудул, на г.Бакусыг, в урочище Пиаболтл и др.
В водоемах территории Ханларского района водится форель, представленная двумя формами: озерной и ручьевой. Популяция озерной, так называемой гейгельской, форели сформировалась в оз.Гейгель и др. озерах этого района после их образования в 12 веке. Гейгельская форель сохранила в основном биологические свойства ручьевой формы, но за 8 веков приобрела и некоторые отличия: увеличение веса, плодовитости и др. Озерная форель обитает в основном в озерах Гейгель и Маралгель. В 1972 и 1976 гг. в оз.Маралгель выпустили около 12 000 молодисеванской форели. Из земноводных обитают обыкновенная жаба и квакша. Из пресмыкающихся наиболее распространены веретеница, ящерицы артвинская, скальная и луговая, ужи обыкновенный и водяной. На территории Ханларского района и северовосточных склонов Малого Кавказа гнездится более 50 видов птиц, в том числе 35 видов в лесном поясе. Наиболее многочисленны зяблик, синица, черный дрозд, пеночка-теньковка, черноголовая славка, обыкновенная зеленушка, чиж. Редко встречаются коршун, домовой сыч, канюк, серая неясыть, зеленый дятел. В субальпийском и альпийском поясах гнездятся альпийская завирушка, горная чечетка, горная овсянка, обыкновенная чечевица, горный конек, красношапочный вьюрок, каменная куропатка, каспийский улар и др. Сравнительно разнообразна здешняя фауна млекопитающих. Благородный олень прежде был многочисленным и постоянным обитателем окрестностей горных озер. В последние полвека олени здесь полностью исчезли. В 1961 году в Гейгельский заповедник завезли 7 кавказских оленей. Численность оленей постепенно росла. В 1975 г. их насчитывали около 50, в 1980 - почти 100, а в 1985 - около 125. Олени держатся в основном в средней полосе лесного пояса, их нередко наблюдают вблизи оз. Гейгель и Маралгель. Косуля предпочитает сравнительно спокойный рельеф, держится около хребтов и их отрогов по опушкам, в субальпийском редколесье с зарослями кустарников и папортников. В 1975-1985 гг. здесь насчитывали в среднем около 30 животных. Кавказский тур обитает по боковым отрогам г.Кяпаз. Численность в среднем около 30 животных. Бурый медведь широко кочует в неурожайные годы. Обитающие здесь медведи относятся к редкому кавказскому подвиду. Здесь также обитают барсук, ласка, каменная куница, волк, лесной кот, обыкновенная белка, соня-полчок, лесная мышь, заяц-русак, 6 видов насекомоядных и др.